Les pépinières de la cluse sont engagées dans la valorisation de l’indigénat de leurs végétaux commercialisés, Pour que ces végétaux soient acclimatés à la région, plus rustiques et vigoureux, de plus l’intérêt est aussi de préserver un patrimoine génétique qui sera essentiel dans le futur pour les changements climatiques et les maladies encore inconnues , pour se faire il s'engage à travers divers labels : un label national et un régional.
Au niveau des certificats d'origine les végétaux proviennent de semencière sélection pour plusieurs raisons, leurs résistances aux maladies, la régularité des fûts, leurs vigueurs